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COG category: Intracellular trafficking and secretion
Genomic element: chromosome
Number of genes found: 124
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# Yersinia pestis Nepal516, Nepal516 >YPN_1934 outer membrane usher protein ATGATTATCAGATTCCGGCTACCGCCATTATCGGTACTGATATATGGCTC AATATTGTTACCGTCACTGATACCCTTGACTATTTTAGGAGGGAGCCTCC CTCCGCCCTCGACATCAACAACGATGCCTGATACTACGTTATATCTTGAA CTCGTGGTCAATGACCGTAACTTTGGGAGTACTGTACCTATTAGTTACCG CAACAACCGTTATTACCTTTCTCAATCACAGCTAAGAACGATTGGGCTTC CTATATCAGAGCCACTGGCACCCGAGATTGCCATTGATAATATGGCGGGC GTGAACGTTAAATATGATGGAGAGAACCAACGCCTATTAATCAATGTTCC CAGCGAGTGGCTACCAAAGCAACAAATCGAGGTTACCGAACAAGATGATT TCAATCTTGCGCAAAGTAGTTTGGGGGCTTTATTCAATTACGATATCTAT GCCACACAAGGTTACCCGTACTCATCTTTAACTCATTTTTCAGCATGGAC AGAACAGCGCATTTTTGATCGTTTTGGCTTGCTCAGTAATACCGGCGTTT ATCGCACCCACTTCCCAAGTAATAACAACACAGATGACGCGAAAGGCTAT ATTCGTTTTGATACCCAGTGGCAGAAGAATGACGAAGAACATCTGCTGCG TTATAGCACAGGTGACCTCATTACCGGTGCTTTGCCATGGAGCAGTGCGA TACGTCTTGGCGGCATTCAGATAGCACGGCATTTTGCTATTCGGCCCGAT CTCATAACCTACCCATTACCACAATTTTCTGGTCAGGCCGCAGTCCCCAG CACCGTTGATCTCTACATTGATAACTTCAGGACACAATCGGCCAATATCA ACCCAGGCCCTTTTGTCATCAATAATGCACCGCGAATCAATGGTGCAGGC 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ATAATTCGGCACAAGTTTTTTATTCTGTTATTAATGATCAGGGCGGCGAA ACTCAAGGTACGCAAAAACTGACCCAATAA >YPN_0430 preprotein translocase SecA ATGCTAATTAAATTATTAACCAAAGTTTTTGGTAGCCGTAACGATCGTAC TCTGCGCCGCATGCAAAAAGTAGTTGATGTCATCAACCGCATGGAACCTG ATATTGAAAAACTGACAGACACCGAATTGCGCGCTAAAACGGATGAGTTC CGTGAGCGTTTAGCGAAAGGTGAAGTGTTGGAAAACTTAATTCCTGAAGC CTTTGCGGTCGTTCGTGAAGCGAGTAAGCGTGTGTTCGGTATGCGTCACT TCGACGTGCAACTGCTGGGTGGGATGGTTCTGAATGAGCGTTGTATCGCA GAAATGCGTACAGGTGAAGGTAAAACCTTGACCGCAACCCTGCCTGCTTA CCTGAATGCGTTGAGTGGCCGTGGCGTGCATGTGGTTACCGTCAACGACT ATTTGGCTCAACGTGACGCCGAAAATAACCGCCCCTTGTTTGAGTTTTTG GGGCTGAGCATTGGTATCAATTTACCGAATATGACTGCGCCAGCCAAACG CGCAGCCTATGCCGCTGATATCACTTACGGTACCAATAACGAATTCGGTT TCGACTATTTACGCGATAATATGGCGTTCAGTCCTGAAGAGCGTGTGCAG CGTCAACTTCACTATGCGTTAGTCGATGAAGTCGACTCCATCCTGATTGA TGAAGCTCGGACCCCGCTGATTATCTCCGGCCCCGCCGAAGACAGTTCCG AAATGTATATTCGGGTTAACAAACTGATTCCAAAACTGATTCGTCAGGAA AAAGAAGACTCGGACAGCTTCCAGGGGGAAGGTCACTTCTCGGTAGATGA GAAATCACGTCAGGTTCATTTGACTGAGCGCGGTCTGATTCTGATTGAAC 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ATGTTTATGCCATTCAGAGAATTTATTTCTAGCCATGTCGGGCGTCACCC CCTCTTCAACCGCGCTCCTGTCGCCGTGATTAATCCCATCACATTGGCGA TTATTGTTGCGTTCTCCACCCTTGCCTTACCACAAACCGCACGGGCGTCG TGCAACAATTCGGGGGGGAGTACCTATATCTGTGAAGGTGAAAATAACGC CGGGATCATCCTAAGTGGAACGGATATCACGGTTGAGACCCAGCTCGGTT TTGGCATCATAGAGCCTGGAGATATAGATCCTGCGCTCTCATTAATCGGC TCTGGTGCCATCAGCTACCTTGATACCAACAGTTCTGCGCTTGATACCGC TGGTGCCTATTCTTTGTCTATCCAGAATGATACGTCGATGATTGGGCAAT CGACATCCACTAACGTTCAGGCCAACGGTTCAATTGGCAGTGGTATCTAT ATTAGCAGCCAGAGTCGCGACAACTCGACCATACAGGTAGACCTCTCCGG CATGTTATCCAGCGGCCTGAATGGCACTCCTGCCCTTTCAATCGACTCAT TGGCAGACAATGATTCAACTATCATTCTGAACATCCATGCTATTTCAGGT ATTGCGGGTATCCAAAGCGATAATAATTCACGGTACGGAACGGCCATCAC CAATGTTGATATTGCCAACGATATCAACGTCGAATATTCAGGAGCCTCGA TCCAAAATTATTCCAATAGTGGCACCAGCATCCTTAATTTAAATTCAAAG AGTATCAGTACAGACTTCGACGCCTTGGATATTAATAATAGCAATTATTC AGGGGAGGTGATGACCGATATCAATATCGATGGCGATATCAGTTCAGCCA ATAGTCAAGCTGCCAGGATTTACAATCATACCAATAGCGGTCTTTCGAGC CTTAGATTTCGCGCAAATAATGTCACGGGTGAATATGCTGGCCTTTATAT 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ATGCGCACTTTGTGGCGAATTATTGCTGGTTTTTTCAAGTGGACCTGGCG TCTACTGAATTTCACCAGAGAGCTTATCCTTAATCTTTTTTTGGCACTGC TTATTTTGATCGGTGTCGGTATTTATTTTCAATTTCAAAGTAAGCCTGTG GAGCCAGTTAAAGGTGCCCTGCTGGTAAATTTAAGCGGTGTGATCGTAGA TCAACCTGCTATCAATAATAAACTACGCCAATGGGGACGTGAGCTATTAG GGGCATCCAGTAACCGCCTACAGGAAAACTCCCTGTTTGATATTGTAGAA ACCATTCGACTGGCAAAAGACGATGACAATATTAACGGCCTGGTTCTGTC TCTGAGTGACTTAACGGGGGCAGATCAATCCTCGCTGCAATATATTGGTA AGGCTCTACGGGAATTTCGCGACACCGGCAAGAAAATTTATGCCGTCGGC GACAGCTACAATCAAACCCAATACTATTTAGCCAGTTTTGCTAATAAGAT TTATCTCTCGCCACAAGGGGCTGTTGACCTACACGGTTTTGCCAGCAATA ACCTTTATTACAAGTCACTGCTGGAAAATCTTAAAGTCACGACCAATATC TTCCGCGTAGGGACTTATAAATCAGCAGTTGAACCGATGATCCGTAATGA TATGTCCGCCGCTGCCCGTGAAGCCGATAGCCGCTGGGTGGGTGGCTTGT GGCAAAACTACCTCACCACGGTCTCCGCTAACCGCCGACTCACCCCAGAA CAACTGTTCCCTGGGGCCGCAGGGGTGATCAGTGGCTTACAGGTAGCGGG TGGCTCACAAGCTAAATACGCACTGGATAGCAAACTGGTAGACCAATTAG CAGCCCGACCAGAAGTAGAAAGTGCACTGGTTGAAGCCTTTGGCTGGAAT AAAAAGACTAATGACTTCAACTACATCAGTATTTATGACTATCAGCCAAC 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ATGAGCAGTATTGATCGCACTCAACCGCTATCGCCAGTAACACAAGTTCA AGCACGGGAAAGCCATGACGTAGCACAACAAACGCGTCAATCCGCTACCC AGACAAAAACCCCGGTCAGTGGTACTGAGGTTAAATTGAGTGATGCGCAG GCAAAATTGATGCAACCGGGCAGTCAGGACATCAATGTGGAGCGTGTCGA AACATTAAAACAGGCTATCCGCAGCGGTCAATTGACTATGGATACCGGTA AAATAGCCGATGCCCTGTTAAAAAACGTGGCGGATGAGCTTAAGAATCAT TAA >YPN_0566 flagellar assembly protein ATGATGACCACGGATATTGCCGGTGACATTATCGCCATGGGGTTACATTT GGTGCTGATGATTTCTATCGTTGCCATCGTCCCAAGTCTGTTAATCGGTC TATTGGTCAGCATTTTTCAGGCCACCACACAGATTAATGAACAAACGCTG AGCTTTTTACCGCGCCTGGTCATGACAATGTTGGTTCTCATCTTTGCGGG TAAATGGATGATGATCAAACTGAGTGATTTTACCGTCAGTATTTTCCAGC AAGCCGCACAGTTGGTTGGGTAA >YPN_3691 fimbrial protein ATGTCTAACGTTAAGAAAAGCACTTTTATTATTGCTTTAGCAACTTTATC TGTTATTTATCAGGCTTTAGCTGCTGATGCAGGGAATGGGCGTATTAAGT TCACTGGAACGGTTATTAATGCACCGTGCTCAATTGCATTAGATTCTACT GATATTAATGTAGACCTAGGGCAGGTCGCGAATAGGGTTCTGGAGACGGG TAACAAATACTCTCAGAGCGTACGGTATAACATTAATCTGCAAGATTGTA GCCTGACGGCTCAAGGGAGTGGGGGGGCCACTTATCCTGCACTGTCTAAA 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ATGGCTAAACATCAGGGTTTAACATTACAGAAAGGTTTTACATTAATTGA ATTGATGGTTGCGGTTGCTATCATTGCAGTCCTCAGTGGTATTGGCATTC CCTCATATCAACGTTATATCCAAAAAGCAGCACTCACCGACATGCTACAG GCCATCGTCCCCTACAAGATGGCGGTAGAACTTTGTGCTCTTGAGCAATC CAACCTTGATAGCTGCAACGCTGGCAGTAATGGGATCCCCGCAGGGCAAG TATCGCGTTATATCAATGCAATAAATATTGCCAAAGGTGTTATTACATTA AGTGGCCAGCATACGCTTACTGGCCTGACATTGGCGATATCACCAACCCG AAACAGCAACGGAAATTTAGTCTGGGCCAGAACATGTACGGCAACAGATA GTGCCATGACTGATAGTTGTAAAGCGGTATTCCGTTTCAATGATAAGGCC CCATCAAATGGTTGA >YPN_1436 pili chaperone protein ATGTTTTCAAAAATAATTATTTTAGTGTTGTCGCTGACGATAAGCAGCAT CCCCGCGTTTGCAGCTATGACGATCAGTGGCACACGTGTGATATTTCCGG CAGCCGAAAAAGAAGTGAGCATACGCACCAATAATAAAGGCGTACAGCCG GCTTTAGTCCAAGTTTGGGTCGATGACGGAAAAACGAATGCTAACATCAA TAGCATGAAGCTTCCTTTTATGGTTACCCCCCCTGTTTTTCGCGTCGAGC CAGGTAAAGGGCAGACCGTGCGAATGATTTATAACGGCATGGCATTACCA CAGAATAAAGAGTCAGTGTTCTGGTTTAATATGCTGGAAATTCCGGCAGT AAAGAAAGAGGGTAATACCCAAAATAAGCTAGAATTGGCTTTTCGTACCC GAATTAAAGTTTTTTATCGTCCTACCTCATTAGAGAGTAATAGTGCCGCA 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AGTGGCTATGAGTCTGTCTTTTGCTAATGCCAGTGTCGTGATGACAGGGA GTCGCATCATATATCCTGCGGCGGCAAGCGAGCACAGCATACAGTTAACC AATAATGACAATTTCCCTAATGCTGTTCAGGTGTGGTTAGACAGTGGCGA TGAAAAATCGACACCAGAAACAGGCAAAGCCCCCTTTATAGTGACTCCAC CGTTCTTTCGTATTGAAGCAAATTCTGGCCAAACATTACGGTTAAAATAT ACGGGAAGTGGCCTTCCTACAGATAGGGAATCCGTATTTTATCTTAACTT TTTACAGATCCCTCCCGTCAATAAAGTAGAGAAAGATAACAAGATGTTAG TGCTGTTGCGTAACCGCATTAAAGTATTTTATCGTCCCGAGAGTATTATC GGCCGTGTTGACCAAGTCTCTACCGCATTGACTTTTAGTCTACGAAAACA AGGAACTAACCTTGTTTTGACAGGAAAAAACCCAACTGGATTCTATGCCA CAATTGCCAGTGGTGAAATCGTGAGTGGGAGCATAAAACTTAAAGTAAAA TCAAATATGATCGCGCCTATGTCTCAAGTTGAGTGGGTGATCCCAAATGC ATCCGTATCCTCGTCAGCAACGATTAACTTTCTGATCATGAATGATTTCG GCGGGCAAGATGCCGGTAGCTATCGTATTTAG >YPN_0547 type II secretion protein ATGATTGTCCCTTTAAAAATACAAGAGTTAATGCGCGAAAGAATGTTAGC CAATATTGACATTAATAAAGTTGAACTCCTGGTTGGTGATCGTAACAAAC TCATCGGATTGCTCTCTCAAACATTCGATGATTTATTTAATAACAATGAA TATAACTTAACGACTCAAGCACAAAAATATATTATTGAAATGATAGCTGA TGAAATAACCGGCTTTGGCCCATTAAGAGAACTTATGGAGGATGATTCCA 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TTTAATCGGTCATCAGTCAGAATAAACGCCGATATCCACAATCTGGCCAA TGAGTTAAACAGTGTTTTCTCTACGGTGAGCAAATGA >YPN_3826 hypothetical protein ATGTTAGCAGCAGAACTATGGCTACGGATGACTCAGGTTAAAGGGCTTGG AGTCGTGAAACGTAGTGCGTTGGCCAAGCGATTACTTGCCAGTGGTGATA TTCATCCGGGGAGGTTAGCTGCCTACGGGCTAGATTCACAACAGTGTCAT CAGTTTGCTCAGCTGTCACCCCGTTATATTGCAGACACGCTAGAGTGGCT AAGTGACCCCAACCACCATTTACTCACTTATGGTGAGCCTGGCTATCCAC CCCGCTTAGTTCATATTGCTGGGGCACCGTTAGTCCTCTTTGTTTCCGGC GAACTTGATGTTCTCTATCGCCCACAGATCGCAATGGTTGGTAGCCGTCA TTTCAGCCACTATGGTGAGCAGTGGGGAAGATATTTTGCCTCAGAGTTGG CTCGCACAGGGTTAGTTATCACTAGTGGTTTAGCTGTAGGCATCGACGGA ATTTGTCATCAGGCGGCTCTGAATATTCAAGGGAGAACTATTGCTGTGCT AGGGAGTGGGTTGGAGAACATATATCCACAGCGGCACAGTCGTTTGGCTA AAGAAATTGAATATCAAGGCGGCGCTTTGGTTTCTGAATTTTTAACGACG GCGTTACCTATTGCTGCTCATTTCCCCAGAAGAAATCGAATTATCAGCGG GCTAAGTGATGCTGTGTTAGTCGTTGAGGCCACTTTAAAAAGTGGCTCTT TGATTACCGCTCGTTATGCGATGGATCAAGGAAGAGATGTGTTCGCATTA CCGGGGCCATTAGGCAGTGCTAGCAGCGAAGGAACACATTGGCTCATTCA ACAAGGCGCTTATTTGGCAACGTCTGTTAAAGATGTCTCAGAGCAGGTCA 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TolB colicin import protein ATGAAGCAGGCATTTCGAGTAGCGCTAGGCTTTTTAGTTTTATGGGCTTC GGTATTACATGCAGAAGTTCGGATTGAGATTACCCAAGGGGTAGACTCAG CACGTCCGATTGGGGTTGTTCCGTTCAAATGGATGGGGCCGGGCACACCA CCTGAAGAAATTGGCGCCATCGTAGGTGCAGATTTACGTAACAGCGGCAA ATTTAACCCAATTGATGCTGCTCGTATGCCACAACAGCCTTCCACAGCCG CTGAAGTAACCCCTGCTGCTTGGACTGCTTTGGGGATCGATGCCGTTGTT GTTGGCCAAGTTCAACCAAGTGCTGACGGTAGCTATGTGGTCTCTTACCA GCTAGTGGATACTTCTGGCTCTGCTGGCAGCATTTTGGCGCAAAATCAGT ATAAAGTGACTAAACAATGGTTACGTTATTCAGCGCACACCGTCAGTGAT GAAGTATTTGAAAAACTCACTGGGATTAAAGGCGCTTTCCGTACTCGCAT TGCTTATGTTGTGAAAACTAACGGTGGTAAATTCCCACATGAATTACGGG TTTCTGATTACGATGGCTACAACCAGTTTGTCGTCCACCGCTCTCCTGAA CCTCTGATGTCACCCGCTTGGTCACCAGATGGTAGCAAAATTGCCTATGT GACTTTTGAAAGTGGCAAATCAGCATTGGTTATTCAGACGCTGGCAAATG GTGCGATTAGGCAAGTGGCCTCATTCCCACGTCATAACGGTGCACCCGCG TTCTCACCTGATGGCACCAAGCTGGCCTTCGCGTTATCTAAAAGCGGTAG CCTGAACTTGTATGTTATGGACTTGGCTTCAGGTCAAATCAGCCAAGTGA CGGATGGTCGTAGCAATAATACTGAACCAAGCTGGTTCCCGGATAGCCAA AATCTGGCTTATACCTCGGATCAGGGGGGGCGTCCACAAGTTTATAAAGT 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chaperone protein PsaB precursor ATGAAGAATCTATTTTTTTCTGCATATAAAAAAGTATTTTCTTATATCAC ATCAATAGTCATATTCATGGTGTCTTTACCTTATGCTTATTCTCAAGATG TTGTTGTCAATACGACTAAGCATCTTTTTACTGTAAAAATAGGGACAACG CGGGTCATTTACCCTTCGTCTTCGACAAAAGGGGTATCCGTATCGGTGGC TAATCCACAGGATTATCCAATATTGGTACAAACCCAAGTTAAAGATGAAG ATAAGACGTCGCCCGCTCCTTTTATTGTTACCCCTCCTTTATTCAGGCTT GATGCTGGGTTACAAGGCCGTGTACGTATTATTCGGACCGGTGGAAAATT CCCTGAAGATCGTGAAACACTGCAATGGTTGTGCCTAACGGGGATCCCAC CTAAGAACGGTGATGCTTGGGGCAATACGCAAAATAATCCAAAAAATTCA TCCCCAACTATGGATATTCAAATGTCTATCAGTACCTGCATAAAATTATT ATTCAGACCCGATAAAGTTAAAGGAGATCCGACGGATAGTGCGGATTCAT TAACTTGGAGATATAAAGGTAACTACTTGGAAGTTAATAATCCAACGCCA TTCTACATGAATTTTTATTCACTCCGTATTGGTGATGAAAAAATAAATTT ATCTGATTTAGGTTCAAAGGATGAAATAAAAAATGGCAGCTATGTTCCGC CATTCTCTTCTAGGGATTTTATTATTCCGGTAAAAAATAAAGGTAAGGCA ACAGAGGTTTTTTGGCAAGTGATTAATGATAATGGTGGTGTGAGCCGGGA ATTTAAAAGCACAGTCCAGTAA >YPN_3915 membrane transport protein TTGCAGGCTCTGGCTGACTATCGGCAACTTAATCTGATCACGACTACCGG 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