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COG category: Intracellular trafficking and secretion
Genomic element: pCD1
Number of genes found: 10
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# Yersinia pestis CO92, CO92 >YPCD1.59 ylpB, needle complex inner membrane lipoprotein GTGAAAGTTAAGACTTCACTGTCAACATTGATATTAATCTTGTTTTTAAC TGGTTGCAAAGTTGATCTTTATACCGGAATTAGTCAGAAGGAAGGGAACG AAATGCTTGCGCTGTTGCGCCAAGAAGGCCTTTCCGCAGACAAAGAGCCA GACAAAGATGGGAAGATTAAGCTCTTGGTTGAGGAGTCAGATGTCGCTCA GGCTATTGATATTCTCAAACGGAAGGGCTATCCACACGAGAGTTTCTCCA CGTTACAGGATGTGTTCCCCAAAGATGGGTTGATATCTTCACCGATAGAA GAGTTGGCGAGGCTTAATTATGCCAAGGCGCAAGAGATCTCCCGCACTTT ATCTGAAATTGACGGGGTATTAGTGGCTCGAGTGCATGTCGTATTGCCTG AAGAGCAAAATAACAAAGGTAAGAAGGGTGTAGCAGCATCCGCTTCGGTT TTTATCAAGCATGCAGCAGATATTCAGTTTGATACCTACATACCTCAGAT TAAACAATTAGTGAATAATAGTATTGAGGGGCTGGCCTATGATCGCATCA GTGTCATTTTGGTGCCATCGGTAGATGTTCGTCAAAGCTCTCATTTACCT CGTAACACGAGCATACTGTCAATTCAAGTGAGTGAAGAGTCAAAAGGGCA TCTTATTGGCTTGTTGTCGTTGCTTATTTTGCTTTTGCCAGTGACCAATC TTGCTCAATATTTTTGGTTACAACGCAAGAAGTGA >YPCD1.52 yscC, outer membrane secretin precursor ATGGCTTTTCCGCTACATTCTTTTTTCAAGCGCGTACTCACCGGGACGTT ACTGTTACTTTCTAACTATAGCTGGGCGCAAGAACTTGATTGGTTGCCTA TACCTTATGTTTATGTGGCGAAGGGGGAAAGTTTACGCGATTTATTAATT GATTTCAGCGCTAATTATGATGCTACAGTGGTAGTAAGCGATAAGATTAA TGACAAAGTTTCCGGCCAGTTTGAGCATGATAACCCTCAGGATTTCCTAC AGCATATTGCCTCCCTTTACAATTTGGTTTGGTACTATGATGGCAATGTG CTCTACATTTTTAAAAATAGTGAGGTAGCGTCTCGTCTCATTCGTTTACA GGAAAGTGAGGCCGCAGAGTTAAAGCTGGCATTACAACGTTCTGGTATAT GGGAGCCTCGTTTTGGCTGGCGCCCTGATGCTAGCAACCGCCTTGTTTAC GTCTCTGGTCCTCCTCGTTATCTTGAATTGGTTGAACAGACCGCAGCCGC ATTGGAACAACAGACGCAAATTCGCAGTGAAAAAACAGGGGCATTAGCGA TTGAGATTTTCCCTCTCAAATATGCATCAGCGAGCGATCGAACTATTCAT TACCGTGATGACGAAGTGGCTGCTCCTGGGGTTGCAACGATACTTCAACG CGTGTTAAGCGATGCCACAATCCAACAAGTGACAGTGGATAATCAGAGAA TACCGCAGGCCGCTACCCGGGCTTCAGCTCAAGCCAAGGTTGAAGCGGAT CCATCGCTCAATGCGATAATAGTGCGCGATTCTCCTGAGCGTATGCCAAT GTATCAACGGTTAATTCATGCGCTTGATAAACCTAGCGCTCGTATTGAAG TGGCGTTATCCATTGTCGATATAAATGCCGACCAACTTACTGAATTAGGT GTGGACTGGCGAGTTGGCATTCGTACTGGCAACAATCATCAGGTGGTAAT AAAAACAACCGGGGATCAAAGTAACATCGCTTCAAACGGTGCATTGGGTA GTTTGATTGATGCTCGCGGGCTTGACTACCTATTAGCAAGAGTCAATTTA CTTGAAAATGAAGGTTCGGCTCAAGTTGTTTCACGTCCGACCCTGCTAAC ACAAGAAAATGCCCAAGCGGTGATTGATCACCATGAAACCTATTACGTCA AAGTGACAGGTAAAGAAGTGGCTGAACTGAAAGGGATCACCTACGGCACT ATGCTGCGTATGACACCAAGGGTGCTGACTCAAGGAGATAAGTCAGAAAT CAGTCTCAATCTACACATTGAGGATGGGAACCAAAAACCGAATAGTTCAG GGATTGACGGAATCCCCACTATCAGTCGTACGGTCGTTGATACTGTCGCT CGCGTGGGACATGGCCAGAGTTTGATTATTGGTGGTATTTATCGTGACGA ATTGAGTGTTGCTCTTAGTAAGGTGCCTTTGCTTGGTGATATTCCTTATC TTGGCGCACTTTTCCGCCGTAAAAGTGAGTTAACTCGCCGTACGGTACGG CTGTTTATCATCGAACCACGGATTATTGACGAAGGTATTGCGCATCATTT AGCGTTAGGTAATGGTCGGGATCTACGTACTGGTATCTTAGCTGTTGATG AAATATCTAATCAAAGCACTACCTTGAATAAGTTATTAGGTGGCTTCCAG TGTCAGCCTTTAAACAAAGCGCAAGAAGTGCAGAAATGGCTGAGTCAAAA CAATAAATCATCCTATCTTACTCAGTGCAAGATGGACAAAAGTTTGGGAT GGCGCGTGGTTGAAGGTGCTTGTACTCCCGCGGAATCATGGTGTGTTTCA GCGCCTAAGCGTGGCGTATTGTGA >YPCD1.61 yscL, type III secretion protein ATGTCACAAACTTGTCAAACAGGTTACGCCTACATGCAGCCATTTGTTCA AATAATACCAAGTAATCTCTCGCTCGCTTGCGGTCTGCGTATTTTGCGCG CCGAAGATTACCAATCCAGTTTAACAACCGAAGAGTTGATTAGTGCCGCA AAACAGGATGCTGAAAAGATCCTGGCTGACGCCCAAGAGGTTTATGAGCA ACAAAAGCAGTTAGGATGGCAGGCTGGCATGGATGAGGCGCGTACCTTAC AGGCGACTTTGATTCATGAAACACAGTTACAATGTCAGCAATTTTATCGC CACGTCGAACAACAGATGAGTGAAGTTGTACTTTTGGCGGTACGTAAAAT CCTCAATGACTATGATCAAGTGGCTATGACACTGCAAGTTGTGCGGGAGG CTTTAGCCTTGGTGAGTAATCAGAAGCAAGTCGTGGTCAGGGTCAACCCT GATCAGGCAGGAGCTATTCGTGAACAAATAGCTAAAGTACATAAAGACTT CCCGGAAATAAGCTATTTAGAGGTGACTGCCGATGCGCGTTTGGATCAAG GGGGCTGTATATTAGAGACTGAGGTAGGTATTATTGACGCGAGTATTGAT GGGCAAATTGAAGCACTTTCTCGGGCAATATCTACCACTTTAGGACAAAT GAAAGTTACAGAATAG >YPCD1.40 yscN, type III secretion system ATPase ATGCTCTCACTAGATCAGATACCTCATCATATTCGTCATGGCATTGTAGG TAGCCGCCTAATCCAAATTAGAGGACGTGTCACTCAAGTGACAGGAACGT TATTAAAAGCGGTAGTGCCAGGTGTGCGCATCGGTGAGTTATGTTACTTA CGTAACCCTGACAACAGCCTGTCTTTACAGGCTGAAGTCATAGGTTTTGC CCAACATCAAGCATTACTTATTCCACTTGGTGAAATGTACGGGATATCTT CTAATACTGAAGTTAGCCCGACAGGGACAATGCATCAGGTTGGGGTGGGT GAACATCTGCTGGGACAGGTGTTGGATGGTTTAGGGCAGCCTTTCGATGG GGGGCATCTCCCTGAACCGGCGGCTTGGTACCCAGTTTATCAGGATGCCC CAGCGCCGATGAGCCGAAAACTTATTACCACACCACTTTCTTTGGGGATC CGGGTTATTGACGGTTTGCTTACCTGTGGCGAGGGGCAAAGAATGGGCAT CTTCGCGGCCGCCGGGGGGGGGAAAAGTACACTGCTTGCTTCGCTTATTC GTAGTGCTGAAGTAGACGTAACCGTGCTGGCGCTTATTGGTGAGCGTGGA CGCGAAGTGCGTGAGTTTATTGAGTCTGATTTAGGCGAAGAGGGGTTACG CAAAGCGGTTCTCGTGGTGGCCACCTCGGATCGGCCCTCAATGGAAAGAG CCAAAGCTGGATTCGTGGCGACATCTATTGCTGAATATTTTCGCGATCAA GGGAAACGCGTATTGTTACTTATGGACTCTGTAACACGGTTTGCTCGTGC TCAGCGTGAAATAGGCTTAGCTGCGGGAGAACCACCGACTCGCCGCGGTT ATCCTCCGTCAGTATTTGCCGCTTTACCCCGTTTGATGGAAAGGGCTGGT CAGTCCAGCAAAGGGTCAATTACGGCTCTCTATACCGTACTGGTCGAAGG GGACGATATGACCGAACCCGTGGCCGACGAAACACGTTCGATACTTGATG GTCATATTATTCTGTCACGGAAATTAGCGGCAGCTAATCATTATCCTGCC ATTGACGTATTACGTTCAGCGAGCAGGGTGATGAATCAAATTGTCAGCAA GGAGCACAAAACCTGGGCGGGGGACTTACGCCGTTTATTGGCCAAATATG AAGAAGTGGAATTGCTGTTGCAAATCGGGGAGTACCAGAAAGGGCAAGAC AAAGAGGCCGATCAAGCGATTGAACGCATGGGGGCGATTCGAGGATGGCT CTGCCAGGGGACGCACGAGTTAAGCCATTTCAATGAGACGCTGAACTTAT TGGAGACGCTGACCCAATGA >YPCD1.43 yscQ, type III secretion protein ATGAGTTTGTTAACCTTGCCACAGGCCAAATTAAGTGAACTGTCGCTACG TCAACGGCTCAGCCATTATCAACAAAACTACTTGTGGGAAGAGGGAAAAC TCGAACTTACCGTCTCTGAGCCTCCTTCGTCTTTGAACTGTATATTACAG TTACAATGGAAGGGAACGCACTTCACGCTCTACTGTTTTGGCAATGATCT GGCTAACTGGTTAACCGCCGACTTACTAGGGGCTCCATTCTTTACTCTGC CGAAAGAGTTGCAACTTGCGCTGTTGGAACGCCAGACAGTTTTCCTGCCG AAACTGGTCTGTAATGATATAGCGACAGCGTCTCTTTCTGTCACGCAACC TCTGTTGAGTTTGCGGCTGTCCCGAGATAATGCGCATATCTCCTTCTGGC TAACCTCAGCTGAGGCTCTGTTCGCTCTGTTACCCGCACGACCCAATTCT GAGCGCATACCTTTGCCTATCCTTATTTCTTTGCGTTGGCATAAAGTATA CCTGACTCTAGATGAGGTTGATTCCCTTCGATTAGGTGATGTGTTGTTGG CCCCTGAGGGGAGTGGGCCTAATTCGCCAGTACTCGCCTATGTTGGTGAG AACCCTTGGGGCTACTTTCAATTACAATCAAATAAATTGGAGTTTATCGG TATGAGTCATGAATCTGACGAACTTAACCCCGAACCATTGACCGATTTGA ACCAACTTCCGGTTCAAGTTAGCTTTGAAGTGGGGCGGCAAATCTTAGAT TGGCACACACTCACTAGCCTGGAGCCGGGTTCTCTTATTGATCTTACAAC ACCTGTTGATGGTGAAGTGCGCTTGCTGGCTAACGGCCGGTTGCTTGGAC ATGGTCGATTGGTCGAGATCCAAGGGCGCCTCGGGGTTCGAATTGAACGC CTGACAGAGGTTACGATTTCATGA >YPCD1.44 yscR, needle complex export protein ATGATCCAGTTACCGGATGAAATTAATCTCATCATCGTTTTATCTTTGCT GACTCTGCTTCCATTGATTTCGGTAATGGCTACATCGTTTGTCAAATTTG CGGTGGTCTTTTCACTACTCCGCAATGCCCTTGGGGTACAGCAAATCCCC CCCAACATGGCAATGTATGGCTTAGCAATCATCCTTAGTCTTTATGTAAT GGCACCCGTTGGCTTCGCGACGCAAGACTATTTACAAGCTAATGAGGTTA GCCTCACGAACATAGAATCTGTTGAGAAATTCTTTGATGAAGGGCTTGCC CCCTATCGCATGTTCCTTAAGCAGCATATTCAAGCGCAAGAATACTCTTT TTTTGTTGACAGCACTAAACAGTTATGGCCCAAGCAGTATGCTGACCGGT TAGAGTCAGACAGCCTGTTCATTTTATTGCCTGCGTTTACGGTGAGTGAG TTGACTCGAGCATTTGAGATAGGCTTTCTCATCTATTTACCATTTATCGT CATTGACCTGGTTATTTCCAATATCTTGTTGGCAATGGGGATGATGATGG TTTCCCCCATGACTATTTCACTGCCATTTAAATTGCTGCTATTTGTTTTA CTTGATGGCTGGACACGACTCACGCATGGGCTGGTGATTAGCTACGGAGG GTGA >YPCD1.45 yscS, needle complex export protein ATGAGTCAAGGTGACATAATTCACTTCACCAGTCAGGCATTATGGCTGGT GCTAGTCCTTTCAATGCCGCCGGTGTTAGTGGCTGCGGTGGTAGGAACTT TGGTATCTTTAGTACAAGCTTTAACGCAAATCCAAGAGCAAACTCTGGGC TTCGTTATCAAATTGATCGCTGTGGTGGTCACACTGTTTGCTACCGCCTC GTGGCTTGGTAATGAATTGCACAGTTTTGCAGAAATGACCATGATGAAGA TACAAGGCATAAGATGA >YPCD1.46 yscT, needle complex export protein ATGATAGCGGATTTAATCCAAAGACCATTGCTCACTTATACCCTGCTGTT GCCTCGTTTTATGGCTTGTTTTGTTATATTGCCAGTGTTAAGTAAACAGC TCCTCGGTGGAGTATTGCTGCGTAATGGTATTGTCTGTTCATTGGCTCTT TATGTCTATCCTGCCGTCGCTAACCAACCTTATATTGAGGTTGATGCGTT TACGTTGATGCTGCTTATCGGCAAAGAGATCATACTGGGGTTATTGATTG GGTTTGTGGCCACCATTCCTTTCTGGGCCTTAGAATCCGCAGGATTTATT GTAGATAACCAAAGAGGTGCCGCGATGGCATCTCTACTCAATCCTGGACT TGATAGTCAAACTAGTCCGACTGGTTTACTTTTGACTCAAACGTTAATAA CAATTTTCTTCAGCGGAGGGGCTTTCCTCTCTTTGCTTTCAGCCCTCTTT CACAGCTATGTAAATTGGCCGGTGGCCAGCTTTTTCCCTGCAGTTAGTGA ACAGTGGGTTGATTTCTTTTATAACCAATTCAGCCAGATACTATTAATCG CCGCTGTATTGGCTGCTCCTTTACTCATCGCTATGTTTTTAGCTGAATTT GGACTTGCACTCATCAGTCGTTTTGCGCCTTCTTTAAACGTCTTTGTGCT GGCTATGCCGATAAAAAGCGCGATAGCAAGCCTGTTGTTGGTTATCTACT GTATGCAAATGATGAGTCATGCCAGTAAAGCAATGCTGTTGGTTATGGAT CCTATAAGTTTACTGATCCCTGTTTTGGAGAAGTAA >YPCD1.47 yscU, needle complex export protein ATGAGCGGAGAAAAGACAGAGCAACCCACCCCGAAGAAAATCCGTGATGC GCGCAAAAAGGGACAGGTAGCGAAAAGTAAGGAAGTGGTCTCTACTGCGC TTATCGTCGCGCTGAGTGCGATGTTAATGGGGCTTTCTGACTACTATTTC GAGCATTTTAGTAAGCTGATGCTAATCCCCGCAGAGCAGAGCTATCTTCC TTTCTCGCAGGCGCTTAGCTATGTGGTTGACAATGTGTTGCTCGAGTTTT TTTATCTCTGTTTTCCTTTGTTAACAGTGGCGGCATTAATGGCGATCGCA TCTCATGTTGTGCAGTATGGTTTTCTTATAAGTGGTGAAGCAATTAAACC GGATATTAAAAAAATCAATCCAATAGAGGGTGCCAAGCGTATCTTTTCCA TCAAAAGTTTAGTGGAGTTTCTCAAATCCATTCTCAAGGTTGTTTTGCTC AGTATACTCATCTGGATAATCATTAAGGGAAATCTAGTCACACTCTTGCA GTTGCCAACCTGTGGAATTGAATGTATTACCCCTTTATTGGGGCAAATAC TCCGGCAGTTGATGGTTATCTGTACTGTTGGCTTTGTGGTCATCTCCATA GCCGACTATGCCTTTGAATACTATCAATATATTAAGGAACTTAAAATGAG CAAGGATGAGATCAAACGCGAGTACAAAGAAATGGAGGGTAGCCCAGAAA TCAAAAGCAAGCGTCGTCAGTTTCATCAAGAGATCCAATCGAGGAACATG CGGGAAAATGTTAAACGCTCATCAGTGGTGGTAGCTAATCCGACCCATAT TGCTATTGGTATTCTTTACAAGCGAGGGGAAACACCACTACCGTTGGTAA CATTCAAATATACCGATGCCCAAGTTCAGACTGTGCGCAAAATAGCAGAA GAAGAAGGGGTGCCTATTTTACAACGTATCCCATTAGCCCGTGCTCTTTA TTGGGATGCGCTCGTCGATCACTATATTCCGGCTGAGCAAATAGAGGCCA CAGCTGAAGTGCTACGATGGCTAGAAAGGCAAAATATCGAGAAACAACAT TCCGAAATGTTATAA >YPCD1.34c yscV, low calcium response protein D ATGAATCCCCATGATCTTGAGTGGCTAAATCGTATTGGCGAGCGTAAAGA TATCATGCTGGCAGTGCTGCTGTTAGCTGTGGTATTCATGATGGTCTTAC CACTCCCCCCCCTTGTGTTGGACATTCTGATTGCTGTTAACATGACCATT TCAGTGGTGTTGTTAATGATAGCGATCTATATCAACTCTCCTTTACAATT TTCAGCTTTCCCTGCGGTGCTACTCGTTACCACGTTATTTCGTCTCGCAC TTTCAGTTAGCACCACCCGCATGATCCTGCTACAAGCTGATGCGGGGCAG ATTGTTTACACCTTTGGTAATTTCGTCGTTGGCGGTAACCTCATCGTCGG GATTGTCATCTTCCTGATCATCACTATTGTGCAATTTTTAGTGATAACGA AAGGCTCAGAACGTGTAGCAGAAGTTAGTGCCAGATTCTCTCTTGATGCG ATGCCGGGTAAACAGATGAGTATCGATGGCGATATGCGAGCCGGGGTGAT CGATGTCAATGAAGCGCGTGAGCGACGCGCGACGATAGAAAAAGAAAGCC AAATGTTCGGTTCTATGGACGGCGCCATGAAGTTCGTCAAAGGGGATGCA ATAGCCGGCCTCATTATTATCTTTGTCAATATATTAGGCGGCGTCACCAT TGGTGTTACCCAAAAAGGATTAGCGGCCGCTGAGGCACTGCAACTCTATT CCATCCTCACTGTCGGGGATGGGATGGTTTCTCAGGTACCTGCCCTGCTG ATAGCTATTACCGCGGGTATTATCGTCACCCGCGTCTCTTCAGAAGATTC ATCAGATCTGGGTAGCGATATTGGCAAACAGGTTGTCGCTCAGCCTAAAG CCATGCTAATTGGTGGCGTACTGCTGTTGCTCTTTGGTCTTATCCCCGGC TTCCCAACAGTCACCTTTCTGATTTTGGCGCTATTGGTAGGCTGTGGTGG TTATATGCTCAGCCGTAAGCAGAGTCGTAATGACGAGGCTAATCAAGACC TGCAATCCATACTGACGAGCGGTTCTGGCGCCCCGGCTGCTCGAACCAAA GCCAAAACAAGTGGGGCAAACAAGGGCCGACTAGGGGAACAAGAAGCATT TGCTATGACGGTTCCCTTGCTGATTGATGTAGATTCAAGCCAACAGGAAG CACTGGAAGCGATAGCACTAAATGATGAGCTGGTTCGAGTGCGCCGTGCT CTTTATCTTGATCTTGGCGTACCTTTCCCTGGGATCCATCTGCGTTTTAA TGAGGGGATGGGTGAAGGCGAATATATTATTTCCTTGCAAGAAGTTCCAG TGGCGCGAGGTGAGCTTAAGGCAGGTTATTTACTCGTGCGTGAATCCGTC AGCCAACTCGAATTACTGGGTATACCCTATGAAAAAGGGGAACATTTGCT ACCCGATCAGGAAGCTTTCTGGGTATCGGTTGAATATGAGGAGCGCCTGG AAAAGTCTCAACTGGAATTTTTCTCTCATTCCCAAGTTCTAACCTGGCAT CTTTCTCATGTCCTACGTGAATATGCCGAAGATTTCATTGGTATCCAAGA AACCCGCTATCTGCTCGAACAGATGGAAGGAGGCTATGGCGAATTAATTA AAGAAGTACAAAGAATCGTTCCCTTACAACGAATGACCGAAATATTACAA CGATTAGTTGGAGAAGATATTTCTATCCGTAATATGCGATCTATTCTTGA AGCTATGGTGGAATGGGGACAAAAAGAGAAAGACGTCGTTCAACTCACAG AATATATCCGCAGTAGTCTAAAACGTTATATCTGCTACAAATACGCTAAT GGCAACAATATATTGCCGGCTTATCTTTTCGATCAAGAAGTAGAAGAAAA AATTCGTAGCGGTGTGCGCCAAACCAGTGCAGGGAGTTATTTGGCATTGG AGCCTGCTGTTACCGAGAGTTTACTTGAACAAGTTCGCAAGACTATTGGC GATCTATCGCAAATCCAGAGTAAACCGGTGCTGATTGTTTCTATGGATAT TCGTCGCTATGTGCGCAAACTGATTGAGAGCGAATACTATGGCTTGCCGG TACTTTCATACCAAGAGCTGACTCAGCAGATTAATATCCAACCACTTGGA CGAATTTGCTTATGA