Gene list
Applied filters:
COG category: NOT ANALYZED
Genomic element: pHCM2
Number of genes found: 117
Show UniProt / TrEMBL protein name | View in Fasta format (DNA) | View in Fasta format (Protein) | ||||
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18, CT18 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name | Locus tag | Product / Description | Genomic element | Type | Begin | Length | Strand | GC-content |
NA | pHCM2 | repeat_region | 104231 | 21 | + | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 6170 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 21399 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 100958 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 23520 | 23 | - | 0.478261 | ||
NA | pHCM2 | stem_loop | 87184 | 57 | + | 0.298246 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 23364 | 19 | - | 0.526316 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 73393 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 71561 | 57 | + | 0.368421 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 98064 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | HCM2_t01 | tRNA-Asn | pHCM2 | tRNA | 22945 | 75 | - | 0.546667 |
NA | pHCM2 | RBS | 36 | 8 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 60377 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 6723 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 83765 | 57 | + | 0.421053 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 74060 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 62309 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104593 | 21 | + | 0.380952 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106230 | 21 | - | 0.47619 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104273 | 21 | + | 0.52381 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 56906 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 23453 | 23 | + | 0.478261 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 105882 | 21 | + | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 84703 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 52503 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106149 | 21 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 72053 | 57 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104252 | 21 | + | 0.380952 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 71558 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 22924 | 20 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 34520 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 3869 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104296 | 21 | + | 0.47619 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106025 | 21 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 77273 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106065 | 21 | + | 0.571429 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 87184 | 26 | + | 0.269231 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 105915 | 21 | + | 0.47619 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106104 | 21 | + | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 79222 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 83755 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 91195 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 65977 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 78671 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 62457 | 24 | - | 0.416667 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 72045 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 1565 | 57 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 78366 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 18895 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106317 | 21 | - | 0.571429 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 81295 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 58779 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 51830 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 90717 | 4 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 102044 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 77707 | 59 | - | 0.40678 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 73940 | 57 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 53310 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 25927 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 76947 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 2499 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 105814 | 21 | + | 0.52381 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 40225 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 27312 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 62772 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 87215 | 26 | - | 0.307692 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 18514 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 22206 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 105843 | 21 | + | 0.47619 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 65230 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 73932 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 62412 | 24 | + | 0.375 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 67865 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 73002 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 70130 | 25 | + | 0.56 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 77235 | 59 | + | 0.38983 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 89581 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 72562 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 80328 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 1137 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 87074 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 8099 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 4138 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 24435 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 100726 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 19113 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 37223 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 53762 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104656 | 21 | + | 0.428571 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104210 | 21 | + | 0.47619 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 47200 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 73005 | 57 | + | 0.350877 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 69459 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 5082 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | stem_loop | 62412 | 69 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 1492 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104699 | 21 | + | 0.380952 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 77795 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 70443 | 25 | - | 0.56 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 83042 | 57 | + | 0.280702 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 15285 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 79862 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104677 | 21 | + | 0.52381 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 658 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 90013 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106270 | 21 | - | 0.380952 | ||
NA | pHCM2 | misc_recomb | 77276 | 57 | + | 0.245614 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 22861 | 20 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 2699 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 31946 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 104635 | 21 | + | 0.52381 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 98824 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 13026 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 37558 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 93773 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | RBS | 6943 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM2 | repeat_region | 106189 | 21 | - | 0.380952 |