Gene list
Applied filters:
COG category: NOT ANALYZED
Genomic element: pHCM1
Number of genes found: 186
Show UniProt / TrEMBL protein name | View in Fasta format (DNA) | View in Fasta format (Protein) | ||||
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18, CT18 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name | Locus tag | Product / Description | Genomic element | Type | Begin | Length | Strand | GC-content |
NA | HCM1.220 | pHCM1 | pseudo | 164126 | 717 | + | 0.67643 | |
NA | pHCM1 | RBS | 93438 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | HCM1.247 | pHCM1 | pseudo | 181660 | 1205 | + | 0.395021 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 108797 | 748 | + | 0.532086 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 118561 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 125916 | 1252 | + | 0.474441 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 151041 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 142985 | 1315 | + | 0.439544 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 130852 | 8 | + | 1 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 118817 | 1155 | - | 0.577489 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 112424 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 77418 | 5 | + | 0.8 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 137390 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 160655 | 820 | - | 0.523171 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 107518 | 96 | + | 0.489583 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 29394 | 474 | + | 0.487342 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 8980 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | HCM1.215 | pHCM1 | pseudo | 161477 | 252 | + | 0.543651 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 43476 | 600 | + | 0.426667 | ||
NA | HCM1.166c | pHCM1 | pseudo | 120793 | 255 | - | 0.494118 | |
NA | pHCM1 | RBS | 115732 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | HCM1.166c | pHCM1 | pseudo | 120793 | 255 | - | 0.494118 | |
NA | pHCM1 | RBS | 115046 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 211832 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 99478 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 41598 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 86876 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 103291 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | HCM1.287c | pHCM1 | pseudo | 216827 | 397 | - | 0.496222 | |
NA | HCM1.226c | pHCM1 | pseudo | 169333 | 1287 | - | 0.647242 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 163306 | 28 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 155823 | 1317 | + | 0.479879 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 100397 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | misc_feature | 26475 | 1602 | + | 0.508115 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 34186 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 175343 | 1317 | + | 0.485953 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 137197 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 173678 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 139159 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 190731 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 217734 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | HCM1.215 | pHCM1 | pseudo | 161477 | 252 | + | 0.543651 | |
NA | pHCM1 | RBS | 198755 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 122356 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | HCM1.217 | pHCM1 | pseudo | 162921 | 1205 | + | 0.539419 | |
NA | pHCM1 | RBS | 104139 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | HCM1.217 | pHCM1 | pseudo | 162921 | 1205 | + | 0.539419 | |
NA | pHCM1 | RBS | 9873 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 171963 | 8 | - | 0.5 | ||
NA | HCM1.170 | pHCM1 | pseudo | 125976 | 940 | + | 0.474468 | |
NA | pHCM1 | RBS | 1697 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 10938 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 134372 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 21650 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 208843 | 5 | + | 0.8 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 174877 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 54578 | 1918 | + | 0.505735 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 40313 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 201421 | 6 | + | 0.666667 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 159639 | 822 | - | 0.525547 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 148723 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 118817 | 1155 | + | 0.577489 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 174461 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 190861 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 183224 | 30 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 185628 | 4 | - | 0.5 | ||
NA | HCM1.170 | pHCM1 | pseudo | 125976 | 940 | + | 0.474468 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 168511 | 822 | + | 0.524331 | ||
NA | pHCM1 | misc_feature | 80748 | 325 | - | 0.507692 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 133555 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 60935 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 112896 | 252 | + | 0.503968 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 207749 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 63313 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 138950 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 180906 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 176753 | 748 | + | 0.537433 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 91595 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 171606 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 15523 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 216718 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 102322 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 5098 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 130750 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 114996 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 161900 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 133176 | 302 | + | 0.403974 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 117896 | 8 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 153546 | 748 | - | 0.537433 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 39318 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 160655 | 820 | - | 0.523171 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 175392 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 3653 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 18387 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 85832 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 108465 | 301 | - | 0.458472 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 106385 | 748 | + | 0.534759 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 212781 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 149568 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 96003 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 37639 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 88308 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 214504 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 215450 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 18920 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 59580 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 159639 | 822 | - | 0.525547 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 536 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 106385 | 748 | + | 0.534759 | ||
NA | HCM1.220 | pHCM1 | pseudo | 164126 | 717 | + | 0.67643 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 1871 | 715 | + | 0.532867 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 163359 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 125916 | 1252 | + | 0.474441 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 202633 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 176752 | 749 | - | 0.536716 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 41991 | 84 | + | 0.285714 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 155772 | 4 | - | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 108797 | 748 | + | 0.532086 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 194320 | 15 | - | 0.666667 | ||
NA | HCM1.287c | pHCM1 | pseudo | 216827 | 397 | - | 0.496222 | |
NA | pHCM1 | RBS | 11488 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 23460 | 8 | - | 1 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 4577 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 47532 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 113587 | 4 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 161418 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 5753 | 4 | - | 0.5 | ||
NA | HCM1.226c | pHCM1 | pseudo | 169333 | 1287 | - | 0.647242 | |
NA | HCM1.240 | pHCM1 | pseudo | 177511 | 312 | + | 0.330128 | |
NA | pHCM1 | repeat_region | 155823 | 1317 | + | 0.479879 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 4004 | 4 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 116194 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 201039 | 133 | + | 0.390977 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 153546 | 748 | - | 0.537433 | ||
NA | pHCM1 | misc_feature | 148263 | 222 | + | 0.40991 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 142985 | 1315 | + | 0.439544 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 18961 | 1691 | + | 0.464222 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 44347 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 98108 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 21526 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 131866 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 125965 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 6334 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 192497 | 8 | - | 1 | ||
NA | HCM1.136a.S.1c | pHCM1 | misc_feature | 107062 | 183 | - | 0.42623 | |
NA | HCM1.240 | pHCM1 | pseudo | 177511 | 312 | + | 0.330128 | |
NA | pHCM1 | RBS | 200684 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 166852 | 5 | + | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 197715 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 85392 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 33564 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 26232 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 4836 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 216982 | 8 | - | 1 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 51238 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 40505 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 175343 | 1317 | + | 0.485953 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 213393 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 157087 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 28345 | 71 | + | 0.478873 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 37297 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 199880 | 5 | - | 0.4 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 154514 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 96996 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 128593 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 43057 | 197 | - | 0.365482 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 181223 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 183224 | 1315 | - | 0.439544 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 163306 | 820 | + | 0.52439 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 184865 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 118259 | 4 | + | 0.75 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 64996 | 4 | + | 0.5 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 212230 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 19759 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | HCM1.247 | pHCM1 | pseudo | 181660 | 1205 | + | 0.395021 | |
NA | pHCM1 | RBS | 115428 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 168511 | 822 | + | 0.524331 | ||
NA | pHCM1 | repeat_region | 1871 | 715 | - | 0.532867 | ||
NA | pHCM1 | RBS | 94993 | 4 | + | 0.75 | ||
insA | HCM1.136 | pHCM1 | misc_feature | 106681 | 6 | + | ||
insA | HCM1.05c | pHCM1 | misc_feature | 2284 | 6 | - | ||
insA | HCM1.205c | pHCM1 | misc_feature | 153992 | 6 | - | ||
insA | HCM1.138 | pHCM1 | misc_feature | 109093 | 6 | + | ||
insA | HCM1.239c | pHCM1 | misc_feature | 177199 | 6 | - | ||
tnpA | HCM1.210c | pHCM1 | pseudo | 157158 | 3497 | - | 0.608808 | |
tnpA | HCM1.210c | pHCM1 | pseudo | 157158 | 3497 | - | 0.608808 |