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COG category: Transcription
Genomic element: pCD1

Number of genes found: 5

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# Yersinia pestis CO92, CO92

>YPCD1.03c 
ATGCTGAGCAGAGAGGACTTTTACATGATAAAGCAAATGCGCCAGCAGGG
GGCGTACATTATCGATATTGCGACTCAGGTGGGTTGCTCTGAACGAACTG
TCAGACGCTACCTCAAATACCCTGAACCGCCAGCCAGAAAGACTCGCCAC
AAAATGGTTAAGCTGAAACCGTTTATGGACTACATCGACATGCGCCTGGC
AGAGAATGTCTGGAATAGCGAGGTCATCCTCGCGGAAATTAAGGCGATG
>YPCD1.09c hypothetical protein
ATGGCTCACGTAACCAGCGTAACACTTGGAGAGCATTTGACAGGTTTTGT
GGGGGAAATGATTCAGTCTGGTCGTTATGGCAATATATCAGAAGTGCTTC
GTGATGCCTTAAGGCTAATGGAAGCACGTGAACAGCGTGTTCAACATGTA
CGCGATATGGTGCTTGCAGGAACAAATGTACCTGTGAGCCATCGTTTAAT
GGATGAGATTTTTTCTGCTGCGGTGAAAGATACTAGTGTATAA
>YPCD1.12c sopB, putative plasmid-partitioning control protein
ATGAAAAGGTCACCAGTGTTACGTAATGCGCCTTCAATTAATTTTGATGA
TGCTAAACCCGCAATCAGCAATGCAGAGCCCTCGGTTTCTGCTCCGGCGG
TGAGTCAGCTTGCTTCTCGAGTTAGTGGCATGAAAGGCAACACAATCGTA
TTACCTGTTTGTGGAAGGAACGTTGCTTTTACGCTTAAAGTGATAGCAGC
ACCTGATGTTGAATCTAAAACAATCGTTTTTAGTGGTAATGAGCGAAACC
AAGCATTATTAAGTGAGACGTCGTTAGATGACTTGATCCCTTCATTTTTA
ACGTCAGGGCAGCAGATCCCCGCCTTTGCACGTGAACATAACGGGAACAT
CGAGGTTGCTGATGGAAGTCGCCGACGTAAAGCCGCGATACTCACCGGAA
GTGACTATAAGGTTCTGGTTGGTAACTTGAATGATGAGCAGATGCTATGG
CTGTCCCAAATTGCTAATGAGTATCGTCCGACGAGTGCTTATGAACGAGG
CCTGCGTTACGCCCAACGGCTAATATCTGAATTTGAAGGTAATATTAGTA
AATTGGCAGAGGCCGAGCATCTCTCTCGCAAAATTATTCAGCGTTGTATT
AAAACGGCTGGGCTGCCCCTTAAAACTATTCAACTGTTTGCTAACCCTAA
TGAATTAAGTGCTCGTAGTGGCGAAGCATTAAGTAAAGCTTATGAAAATA
ATGTTGATACGCTAAAGCGAGTTACGCATAAAATTATGAAGCAAAAACAG
GAAGGTCGCCAGTTTACTACGGAAGAATTAATCGTATTGCTGATGCCTGA
GAGAAAACAGCCAGAGAACATTCATAAAAAAAGCTTTGGCAAAAATATAG
AAGCAAAATATTCAAAAGACAATGTTTCTTTCTATCTCAAATCTGTGCCA
GAGTCCTTGGTTAAACAAATAGAAGAACTCTTGAATACCTATGCAAAGGA
ACATTCTTTGTAG
>YPCD1.49 virF, transcriptional regulator
ATGGCATCACTAGAGATTATTAAATTAGAATGGGTCACACCTATATTTAA
GGTTGTTGAGCATTCACAAGATGGCCTATATATTCTTTTGCAAGGTCAGA
TTTCATGGCAGAGCAGCGGTCAGACATATGATTTAGATGAGGGGAATATG
CTGTTTTTGCGTCGTGGCAGCTATGCTGTTCGATGTGGTACAAAAGAACC
CTGCCAATTACTTTGGATTCCATTACCCGGCAGTTTTTTGAGTACTTTTT
TGCATCGCTTTGGTTCTTTGCTTAGTGAAATTGGACGAGACAACTCCACA
CCCAAACCATTGTTAATTTTTAATATTTCACCAATATTATCACAATCCAT
TCAAAATCTATGTGCCATATTGGAACGGAGTGATTTTCCGTCAGTATTAA
CGCAACTGCGTATTGAGGAATTACTGCTTTTGCTTGCCTTTAGCTCGCAA
GGGACTTTATTTCTCTCGGCTCTGCGCCATTTAGGCAACCGCCCAGAAGA
ACGGTTGCAAAAATTTATGGAGGAAAATTATCTACAAGGGTGGAAGCTAA
GCAAATTTGCGCGAGAATTCGGCATGGGATTAACCACATTCAAAGAACTG
TTTGGTACAGTTTATGGCATTTCACCACGCGCCTGGATAAGCGAGCGACG
TATTCTCTATGCTCACCAATTACTTCTTAATGGTAAGATGAGTATTGTTG
ATATTGCCATGGAAGCGGGGTTCTCGAGTCAGTCTTATTTCACTCAAAGT
TATCGACGTCGCTTCGGATGCACTCCAAGCCAAGCCCGTCTTACTAAAAT
AGCAACCACAGGCTAA
>YPCD1.72c ypkA, secreted protein kinase
ATGAAAAGCGTGAAAATCATGGGAACTATGCCACCGTCGATCTCCCTCGC
CAAAGCTCATGAGCGCATCAGCCAACATTGGCAAAATCCTGTCGGTGAGC
TCAATATCGGAGGAAAACGGTATAGAATTATCGATAATCAAGTGTTGCGC
TTGAACCCCCACAGTGGTTTTTCTCTCTTTCGAGAAGGGGTTGGTAAGAT
CTTTTCGGGGAAGATGTTTAACTTTTCAATTGCTCGTAACCTTACTGACA
CACTCCATGCGGCCCAGAAAACGACTTCGCAGGAGCTAAGGTCTGATATC
CCCAATGCTCTCAGTAATCTCTTTGGAGCCAAGCCACAGACCGAACTGCC
GCTGGGTTGGAAAGGGGAGCCCTTGTCAGGAGCTCCGGATCTTGAAGGGA
TGCGAGTGGCTGAAACCGATAAGTTTGCCGAGGGCGAAAGCCATATTAGT
ATAATAGAAACTAAGGATAAGCAGCGGTTGGTAGCTAAGATTGAACGCTC
CATTGCCGAGGGGCATTTGTTCGCAGAACTGGAGGCTTATAAACACATCT
ATAAAACCGCGGGCAAACATCCTAATCTTGCCAATGTTCATGGCATGGCT
GTGGTGCCATACGGTAACCGTAAGGAGGAAGCATTGCTGATGGATGAGGT
GGATGGTTGGCGTTGTTCTGACACACTAAGAACCCTCGCCGATAGCTGGA
AGCAAGGAAAGATCAATAGTGAAGCCTACTGGGGAACGATCAAGTTTATT
GCCCATCGGCTATTAGATGTAACCAATCACCTTGCCAAGGCAGGGGTAGT
ACATAACGATATCAAACCCGGTAATGTGGTATTTGACCGCGCTAGCGGAG
AGCCCGTTGTTATTGATCTAGGATTACACTCTCGTTCAGGGGAACAACCT
AAGGGGTTTACAGAATCCTTCAAAGCGCCGGAGCTTGGAGTAGGAAACCT
AGGCGCATCAGAAAAGAGCGATGTTTTTCTCGTAGTGTCAACCCTTCTAC
ATTGTATCGAAGGTTTTGAGAAAAATCCGGAGATAAAGCCTAATCAAGGA
CTGAGATTCATTACCTCAGAACCAGCGCACGTAATGGATGAGAATGGTTA
TCCAATCCATCGACCTGGTATAGCTGGAGTCGAGACAGCCTATACACGCT
TCATCACAGACATCCTTGGCGTTTCCGCTGACTCAAGACCTGATTCCAAC
GAAGCCAGACTCCACGAGTTCTTGAGCGACGGAACTATCGACGAGGAGTC
GGCCAAGCAGATCCTAAAAGATACCCTAACCGGAGAAATGAGCCCATTAT
CTACTGATGTAAGGCGGATAACACCCAAGAAGCTTCGGGAGCTATCTGAT
TTGCTTAGGACGCATTTGAGCAGTGCAGCAACTAAGCAATTGGATATGGG
GGGGGTTTTGTCGGATCTTGATACCATGTTGGTGGCACTCGACAAGGCCG
AACGCGAGGGGGGAGTAGACAAGGATCAGTTGAAGAGTTTTAACAGTTTG
ATTCTGAAGACTTACAGAGTGATTGAAGACTATGTCAAAGGCAGAGAAGG
GGATACCAAGAATTCCAGTACGGAAGTATCCCCCTATCATCGCAGTAACT
TTATGCTATCGATCGTCGAACCTTCACTGCAGAGGATCCAGAAGCATCTG
GACCAGACACACTCTTTTTCTGATATCGGTTCACTAGTGCGCGCACATAA
GCACCTGGAAACGCTTTTAGAGGTCTTAGTCACCTTGTCACAGCAAGGGC
AGCCCGTGTCCTCTGAAACCTACGGCTTCCTGAATCGATTAACTGAGGCT
AAGATCACCTTGTCGCAGCAATTGAATACTCTCCAGCAGCAGCAGGAGAG
TGCGAAAGCGCAATTATCTATTCTGATTAATCGTTCAGGTTCTTGGGCCG
ATGTTGCTCGTCAGTCCCTGCAGCGTTTTGACAGTACCCGGCCTGTAGTG
AAATTCGGCACTGAGCAGTATACCGCAATTCACCGTCAGATGATGGCGGC
CCATGCAGCTATTACGCTACAGGAGGTATCGGAGTTTACTGATGATATGC
GAAACTTTACAGTGGACTCTATTCCACTACTGATTCAACTTGGACGAAGC
AGTTTAATGGATGAGCATTTGGTTGAACAGAGAGAAAAGTTGCGAGAGCT
GACGACCATCGCCGAGCGACTGAACCGGTTGGAGCGGGAATGGATGTGA